服务内容
一、定量蛋白组学
蛋白组学是研究整体水平上蛋白质的组成与调控的学科，分析蛋白质的组成成分（定性），表达水平（定量），以及修饰状态（修饰），了解蛋白之间的相互作用与联系，获得蛋白水平上关于疾病、代谢等生物学过程的变化信息。
定量蛋白组学技术流程
1. Label Free定量蛋白组
一种基于质谱的无标记定量蛋白组学方法，用于对样本中的蛋白进行定性和相对定量分析。与传统的标记技术相比，Labelfree技术不需要对蛋白质样品进行化学标记，因此更加简便和灵活。
2. DIA定量蛋白组
DIA是将整个质谱扫描质量范围分为若干小窗口，依次对每个窗口的所有离子进行碎裂。因此,DIA能够对复杂样品中几乎所有可检测的分子进行定量测定，解决了DDA方法中TOPN原则中低丰度蛋白被抑制从而检测不到的问题。
3. 微量蛋白质组
使用基本无多肽/蛋白损失的特殊化前处理配合高灵敏度和最小离子损失率的质谱分析方法，实现微量样本的正常数据分析。
4. 4D定量蛋白组
常规的质谱数据包含保留时间、质荷比和离子强度三维信息，4D在此基础上增加了碰撞截面积(CCS)即离子淌度(mobility)的结果。硬件上，离子淌度增加了离子化肽段的分离，实现了离子积累与聚焦，可提高鉴定深度与灵敏度。在数据上，增加了CCS信息，也提高了鉴定结果的可靠性。
5. TMT定量蛋白组
TMT技术采用多个稳定同位素标签，特异性标记多肽的氨基基团进行串联质谱分析，能够同时分析最多18个不同样本的蛋白质相对含量差异。因为不同标记的相同肽段是同时进入质谱分析，因此有着非常好的定量准确性。
6. PRM靶蛋白相对/绝对定量
PRM（平行反应监测）方法只选取和检测目标蛋白相关的信号，通过采集目标肽段的高分辨率MS2质谱图，排除其他离子的干扰。可以实现高特异性、高准确性地对目标蛋白定量，借助合成标准肽，可绝对定量。
7. 宏蛋白组
对样本中所有菌的蛋白进行鉴定，正常需要宏基因组结果或者提供主要菌的种属信息。
二、修饰定量蛋白组
翻译后修饰(Post-translational modification,PTM)是指对翻译后的蛋白质进行共价加工的过程，通过在一个或多个氨基酸残基加上修饰基团，可以改变蛋白质的理化性质，进而影响蛋白质的空间构象和活性状态，亚细胞定位等。由于修饰的蛋白质在样本中的含量低且动态范围广，检测前需要对修饰的蛋白质或肽段进行富集，然后进行质谱鉴定。
基于质谱的修饰蛋白组学流程
1. 磷酸化定量蛋白组
常见修饰点：Ser/Thr/Tyr
相关应用范围：信号转导、细胞周期、调控机理、抗逆、生长发育及癌症机理等。
2. 二硫键蛋白组
常见修饰点：Cys
相关应用范围：蛋白结构稳定、蛋白活性、生物药设计、药效和安全性评价等。
3. SUMO化定量蛋白组
常见修饰点：Lys
相关应用范围：胚胎发育、心脏和颅面发育、植物免疫反应、DNA损伤修饰、肿瘤耐药性等。
4. 甲基化定量蛋白组
常见修饰点：Arg/Lys
相关应用范围：表观遗传、癌症机理、衰老、神经退行性疾病、蛋白转位及信号转导、组蛋白功能。
5. 乙酰化定量蛋白组
常见修饰点：Lys
相关应用范围：基因表达调控、细胞防御机制、细胞凋亡与代谢、细胞周期、转录激活与沉默、蛋白质稳定性、神经退行性病变等。
6. 糖基化定量蛋白组
常见修饰点：Asn(N)、Ser/Thr(O)
相关应用范围：细胞识别、分化、胁迫应答、信号传导、免疫应答、神经退行性疾病、代谢性疾病及感染性疾病研究。
7. 乳酸化定量蛋白组
常见修饰点：Lys
相关应用范围：糖酵解相关细胞功能、巨噬细胞极化、神经系统调控、肿瘤发生、败血症和免疫疾病发生发展、水稻谷粒发育等重要生命活动。
8. 泛素化定量蛋白组
常见修饰点：Lys
相关应用范围：细胞周期、细胞凋亡、蛋白降解、防御机制、光形态发生、信号转导、植物生长发育、癌症和神经退行性疾病。
三、化学蛋白质组
现代新药研究与开发的关键首先是寻找和确定分子药靶。做药物与靶点蛋白结合,需要先进行靶蛋白筛选，而后进行潜在位点筛选，最后进行位点验证。
常用方法有药物亲和反应靶标稳定性(DARTS,Drugaffinity responsive targetstability)，限制性酶解-质谱分析(Lip-MS,Limited proteolysis mass spectrometry)、细胞热转移实验以及衍生的热蛋白组。
四、多肽组学
多肽组学指的是对2至50个氨基酸（0.2至10kDa）的内源性肽的定性和定量研究。多肽存在于细胞和生物体液中，有着特定的生理和生物功能。例如血管舒张、氧化应激等。因此特定肽或肽表达模式的变化可以作为正常生理或疾病特异性病理过程或治疗干预的潜在生物标志物。常规多肽组是对样本做提取，收集小于10kDa的肽段并进行质谱分析。
多肽组学流程
活性多肽组
生物活性肽(Biologicallyactive peptides or bioactive peptides)是含有2-20个氨基酸残基，通过肽键连接的蛋白质片段，具有积极的生物效应。百泰派克基于机器学习方法构建不同活性模型（抗氧化、抗菌、降压、降血糖、抗炎、致敏性、潜在毒性、鲜味肽和苦味肽）进行预测，并提供分子对接服务。
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